Църковно-историческият музей включва основната колекция от експонати, свързани с историята на манастира от създаването му от неговия основател св. Йоан Рилски до края на XIX в. Включва образци на църковното изкуство – стенописи, икони, църковна утвар, богослужебни одежди, напрестолни кръстове, ръкописни и старопечатни книги, щампи и др. Централно място в експозицията заема Рафаиловият кръст, изработен от монах Рафаил в началото на XIX в. Кръстът представлява неповторима творба на българската миниатюрна дърворезба.
Вход:
– възрастни – 8 лв.
– ученици до 18 г., пенсионери, братства – 2 лв.
– семеен билет: възрастен – 4 лв.; дете – 2 лв.
